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In Toscana scorre, nella sua parte iniziale, il terzo fiume più importante d'Italia, il Tevere; al secondo posto troviamo l'Arno, che è interamente incluso in questa regione ed attraversa prima il capoluogo Firenze e pochi chilometri prima della foce Pisa.Altri due fiumi con corso che si sviluppa completamente in Toscana e che superano i 100 chilometri di lunghezza sono l'Ombrone ed il Serchio, entrambi sfociano lungo la fascia costiera occidentale.
Diversi dei corsi d'acqua toscani hanno solamente un tratto di solito molto breve in questa regione, prima di proseguire verso nord o nord-est in Emilia-Romagna o nelle Marche nel caso del Foglia, con sorgente negli Appennini, non distante dal confine regionale; fa eccezione il Magra che si sviluppa in gran parte in Toscana, ma conclude il suo tragitto in Liguria, con orientamento da nord verso sud.
| Fiume | Lunghezza | Sorgente | Foce | Province attraversate |
| Tevere (1) | 405 Km | Monte Fumaiolo | Mar Tirreno | Forlì-Cesena, Arezzo, Perugia, Terni, Viterbo, Rieti, Roma |
| Arno | 241 Km | Monte Falterona | Mar Ligure | Arezzo, Firenze, Prato, Pisa |
| Reno (2) | 211 Km | Monte Le Lari | Mar Adriatico | Pistoia, Bologna, Ferrara, Ravenna |
| Ombrone | 160 Km | San Gusmè | Mar Tirreno | Siena, Grosseto |
| Montone (3) | 140 Km | Passo del Muraglione | Mar Adriatico | Firenze, Forlì-Cesena, Ravenna |
| Enza (4) | 112 Km | Monte Palerà | Po | Massa-Carrara, Parma, Reggio Emilia |
| Serchio | 111 Km | Monte Soraggio | Mar Ligure | Lucca, Pisa |
| Santerno (5) | 99 Km | Passo della Futa | Reno | Firenze, Bologna, Ravenna |
| Foglia (6) | 90 Km | Monte Sovara | Mar Adriatico | Arezzo, Pesaro e Urbino |
| Lamone (7) | 90 Km | Colla di Casaglia | Mar Adriatico | Firenze, Ravenna |
| Senio (8) | 88 Km | Poggio dell'Altello | Reno | Firenze, Ravenna |
| Paglia (9) | 86 Km | Pian dei Renai | Tevere | Siena, Viterbo, Terni |
| Fiora (10) | 80 Km | Santa Fiora | Mar Tirreno | Grosseto, Viterbo |
| Idice (11) | 78 Km | Monte Oggioli | Reno | Firenze, Bologna, Ferrara |
| Elsa | 75 Km | Poggio di Pescina | Arno | Siena, Firenze, Pisa |
| Cecina | 73 Km | Poggio di Montieri | Mar Ligure | Grosseto, Siena, Pisa, Livorno |
| Albegna | 70 Km | Monte Buceto | Mar Tirreno | Grosseto |
| Bruna | 70 Km | Colline Metallifere | Mar Tirreno | Grosseto |
| Magra (12) | 70 Km | Monte Corno | Mar Ligure | Massa-Carrara, La Spezia |
| Marecchia (13) | 70 Km | Alpe della Luna | Mar Adriatico | Arezzo, Rimini |
| Merse | 70 Km | Prata | Ombrone | Grosseto, Siena |
| Sillaro (14) | 66 Km | Monte Tre Poggioli | Reno | Firenze, Bologna, Ravenna, Ferrara |
| Rabbi (15) | 63 Km | Monte Falco | Montone | Firenze, Forlì-Cesena |
(1) Fino al 1923 nasceva in Toscana, ma Mussolini modificò i confini regionali in modo da avere le sorgenti ed il conseguente breve tratto iniziale del fiume nella sua provincia di origine; parti centrali e finali sono in Umbria e Lazio.
(2) Nasce e scorre in Toscana solo per i chilometri iniziali, il resto del suo corso è in Emilia-Romagna.
(3) Nasce in Toscana col nome di Troncalosso, ma già dopo pochi chilometri entra in Emilia-Romagna, dove, all'altezza di San Benedetto in Alpe, assume il nome Montone; a sud di Ravenna si congiunge con il Ronco dando origine al corso d'acqua denominato Fiumi Uniti, che sfocia nel Mar Adriatico 10 chilometri dopo.
(4) Nasce e scorre per pochi chilometri in Toscana, prima di proseguire in Emilia-Romagna per il resto del suo corso.
(5) Solo il primo pezzo è in Toscana, con gran parte del corso in Emilia-Romagna.
(6) Una prima breve parte è in Toscana, il rimanente tragitto si svolge nelle Marche.
(7) Solamente il primo tratto è in Toscana, mentre il resto del fiume scorre in Emilia-Romagna.
(8) Scorre in Toscana nel tratto iniziale, prima di proseguire in Emilia-Romagna.
(9) Il suo corso coinvolge tre regioni, Toscana, Lazio ed infine Umbria.
(10) Conclude il suo tragitto in Lazio, dopo due tratti in cui funge da confine fra questa regione e la Toscana.
(11) Soltanto i primi 4 km di corso sono in Toscana, tutti gli altri in Emilia-Romagna.
(12) Il tratto finale è in Liguria.
(13) Nasce in Toscana, entrando in Emilia-Romagna dopo una manciata di chilometri, ma con un altro tratto in Toscana poco dopo, nell'exclave di Ca' Raffaello.
(14) Solo il primo breve tratto è in Toscana, col resto del fiume in Emilia-Romagna.
(15) Per una breve parte iniziale scorre in Toscana, prima di entrare in Emilia-Romagna.