La capitale Città del Guatemala si trova nella parte sud-orientale del Paese ed è al centro di una conurbazione di circa 3 milioni di persone, che comprende altri grandi centri urbani, a partire da Mixco; non distante dal confine col Messico si superano i 4.000 metri d'altitudine, grazie al vulcano Tajumulco, la cima più alta di tutto il Centro America.
Il Guatemala è suddiviso amministrativamente in 22 dipartimenti, con quello della capitale che è di gran lunga il più popolato; 1/3 del territorio è costituito dal dipartimento di Petén, che corrisponde alla parte settentrionale del Paese.
Buona parte delle città principali si trova nell'agglomerato urbano della capitale, Città del Guatemala, con gli altri dipartimenti che hanno solamente un centro urbano rilevante, il capoluogo; si può notare inoltre l'assenza di grandi città lungo la costa sull'Oceano Pacifico, con una sola città su quella più breve sull'Oceano Atlantico.