La capitale Il Cairo, la maggior metropoli africana, così come le altre due principali città Alessandria e Giza si trovano nella parte settentrionale del Paese; la cima più elevata è ubicata più ad est, nella porzione asiatica dell'Egitto, nella Penisola del Sinai.
L'Egitto è suddiviso a livello amministrativo in 27 governatorati, con quello di Wadi al-Jadid che occupa gran parte dell'area desertica ad ovest del Nilo e che costituisce più del 40% del territorio, ma ha una densità di popolazione di appena 0,59 abitanti per km²; i due governatorati di Il Cairo e Giza sono invece quelli più popolosi, col primo che supera i 10 milioni di abitanti ed il secondo sopra i 9 milioni di persone.
La distribuzione della popolazione è sbilanciatissima verso l'area compresa fra Il Cairo, Alessandria e Porto Said ed in misura minore lungo le rive del Nilo nella parte centrale e meridionale del Paese, con pochissimi centri urbani rilevanti in altre zone.