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La capitale e maggiore città Gerusalemme si trova nella parte centrale del Paese, vicino ai territori palestinesi della Cisgiordania, con gli altri due centri abitati maggiori sulla fascia costiera mediterranea; nell'estremità nord-orientale, nei territori occupati delle Alture del Golan, si raggiungono e superano i duemila metri d'altezza.
Israele è suddiviso in 6 distretti, con quello meridionale che costituisce da solo poco meno di 2/3 del territorio; il distretto centrale, situato fra la capitale e Tel Aviv è invece quello più popolato ed unico sopra i 2 milioni di abitanti, con tutti gli altri comunque oltre il milione di persone.
A parte Gerusalemme, che si avvicina ad un milione di persone, tutte le altre città rimangono sotto il mezzo milione di abitanti; la zona compresa fra la capitale e Tel Aviv presenta una grande concentrazione di centri abitati, mentre l'area settentrionale e soprattutto quella meridionale più desertica, sono meno densamente popolate.