Nairobi, la capitale e maggiore città del Kenya, si trova nella parte centro-meridionale del Paese, non molto distante dalla montagna più alta, chiamata come lo Stato e che è una delle poche cime oltre i 5.000 metri d'altezza dell'Africa; lungo la costa troviamo poi l'unica altra città sopra il milione di abitanti, Mombasa; la zona più occidentale è occupata da una porzione del maggior lago africano, il Vittoria.
Il Kenya è suddiviso in 47 contee, con le due maggiori, Turkana e Marsabit nella parte nord-occidentale del Paese, che costituiscono assieme quasi 1/4 del territorio, mentre quella di Nairobi è la più popolata con quasi 5 milioni di abitanti, nonostante sia la terza più piccola dopo quelle di Mombasa e di Vihiga.
Sono presenti 22 città sopra i 100.000 abitanti, distribuite soprattutto vicino alla capitale Nairobi o ad ovest di essa, con poche eccezioni, a partire da Mombasa, situata lungo la fascia costiera sull'Oceano Indiano.